HistoAtlas: Een Pan-Carcinoom Morfologie Atlas die Histomica verbindt met Moleculaire Programma's en Klinische Uitkomsten
HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes
March 17, 2026
Auteurs: Pierre-Antoine Bannier
cs.AI
Samenvatting
Wij presenteren HistoAtlas, een pan-kanker computationele atlas die 38 interpreteerbare histologische kenmerken extraheert uit 6.745 diagnostische H&E-coupes van 21 TCGA-kankertypes en elk kenmerk systematisch koppelt aan overleving, genexpressie, somatische mutaties en immuunsubtypen. Alle associaties zijn gecorrigeerd voor covariaten, gecorrigeerd voor meervoudig toetsen en ingedeeld in bewijskracht-categorieën. De atlas onthult bekende biologie, van immuuninfiltratie en prognose tot proliferatie en kinase-signalering, en legt tegelijkertijd compartimentspecifieke immuunsignalen en morfologische subtypen met uiteenlopende uitkomsten bloot. Elk resultaat is ruimtelijk traceerbaar naar weefselcompartimenten en individuele cellen, statistisch gekalibreerd en openlijk doorzoekbaar. HistoAtlas maakt systematische, grootschalige biomarkerontdekking mogelijk vanuit routinematige H&E-coupes, zonder gespecialiseerde kleuringen of sequencing. Data en een interactieve webatlas zijn vrij beschikbaar op https://histoatlas.com.
English
We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .