HistoAtlas: Um Atlas Pan-Cancer de Morfologia que Conecta a Histômica a Programas Moleculares e Desfechos Clínicos

HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes

March 17, 2026

Autores: Pierre-Antoine Bannier

cs.AI

Resumo

Apresentamos o HistoAtlas, um atlas computacional pan-cancro que extrai 38 características histómicas interpretáveis de 6.745 lâminas diagnósticas de H&E em 21 tipos de cancro do TCGA e vincula sistematicamente cada característica à sobrevivência, expressão génica, mutações somáticas e subtipos imunes. Todas as associações são ajustadas para covariáveis, corrigidas para testes múltiplos e classificadas em níveis de força de evidência. O atlas recupera biologia conhecida, desde infiltração imune e prognóstico até proliferação e sinalização por cinases, ao mesmo tempo que revela sinais imunes específicos de compartimento e subtipos morfológicos com desfechos divergentes. Cada resultado é espacialmente rastreável até compartimentos teciduais e células individuais, estatisticamente calibrado e consultável abertamente. O HistoAtlas permite a descoberta sistemática e em larga escala de biomarcadores a partir de H&E de rotina, sem coloração especializada ou sequenciação. Os dados e um atlas web interativo estão disponíveis gratuitamente em https://histoatlas.com.

English

We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .