Democratizando a los científicos de IA mediante ToolUniverse

Democratizing AI scientists using ToolUniverse

September 27, 2025

Autores: Shanghua Gao, Richard Zhu, Pengwei Sui, Zhenglun Kong, Sufian Aldogom, Yepeng Huang, Ayush Noori, Reza Shamji, Krishna Parvataneni, Theodoros Tsiligkaridis, Marinka Zitnik

cs.AI

Resumen

Los científicos de IA están desarrollando sistemas computacionales que funcionan como colaboradores en el descubrimiento. Estos sistemas siguen siendo difíciles de construir porque son personalizados, están vinculados a flujos de trabajo rígidos y carecen de entornos compartidos que unifiquen herramientas, datos y análisis en un ecosistema común. En el ámbito de las ómicas, los ecosistemas unificados han transformado la investigación al permitir la interoperabilidad, la reutilización y el desarrollo impulsado por la comunidad; los científicos de IA requieren una infraestructura comparable. Presentamos ToolUniverse, un ecosistema para construir científicos de IA a partir de cualquier lenguaje o modelo de razonamiento, ya sea abierto o cerrado. TOOLUNIVERSE estandariza cómo los científicos de IA identifican y llaman a las herramientas, integrando más de 600 modelos de aprendizaje automático, conjuntos de datos, APIs y paquetes científicos para el análisis de datos, la recuperación de conocimiento y el diseño experimental. Refina automáticamente las interfaces de las herramientas para su uso correcto por parte de los científicos de IA, crea nuevas herramientas a partir de descripciones en lenguaje natural, optimiza iterativamente las especificaciones de las herramientas y las compone en flujos de trabajo agentivos. En un estudio de caso sobre hipercolesterolemia, ToolUniverse se utilizó para crear un científico de IA que identificó un análogo potente de un fármaco con propiedades predichas favorables. El código abierto de ToolUniverse está disponible en https://aiscientist.tools.

English

AI scientists are emerging computational systems that serve as collaborative partners in discovery. These systems remain difficult to build because they are bespoke, tied to rigid workflows, and lack shared environments that unify tools, data, and analyses into a common ecosystem. In omics, unified ecosystems have transformed research by enabling interoperability, reuse, and community-driven development; AI scientists require comparable infrastructure. We present ToolUniverse, an ecosystem for building AI scientists from any language or reasoning model, whether open or closed. TOOLUNIVERSE standardizes how AI scientists identify and call tools, integrating more than 600 machine learning models, datasets, APIs, and scientific packages for data analysis, knowledge retrieval, and experimental design. It automatically refines tool interfaces for correct use by AI scientists, creates new tools from natural language descriptions, iteratively optimizes tool specifications, and composes tools into agentic workflows. In a case study of hypercholesterolemia, ToolUniverse was used to create an AI scientist to identify a potent analog of a drug with favorable predicted properties. The open-source ToolUniverse is available at https://aiscientist.tools.