HistoAtlas: un atlante pan-tumorale della morfologia che collega l'istomica ai programmi molecolari e agli outcome clinici
HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes
March 17, 2026
Autori: Pierre-Antoine Bannier
cs.AI
Abstract
Presentiamo HistoAtlas, un atlante computazionale pan-cancro che estrae 38 caratteristiche istologiche interpretabili da 6.745 vetrini diagnostici H&E relativi a 21 tipi di cancro del TCGA, collegando sistematicamente ogni caratteristica a sopravvivenza, espressione genica, mutazioni somatiche e sottotipi immunitari. Tutte le associazioni sono corrette per covariabili, aggiustate per test multipli e classificate in livelli di forza dell'evidenza. L'atlante recupera biologia nota, dall'infiltrazione immunitaria e prognosi alla proliferazione e segnalazione chinasica, scoprendo al contempo segnali immunitari specifici per compartimento e sottotipi morfologici con esiti divergenti. Ogni risultato è tracciabile spazialmente fino ai compartimenti tissutali e alle singole cellule, statisticamente calibrato e consultabile liberamente. HistoAtlas consente la scoperta sistematica e su larga scala di biomarcatori a partire da colorazioni H&E di routine, senza necessità di colorazioni specializzate o sequenziamento. I dati e un atlante web interattivo sono liberamente disponibili all'indirizzo https://histoatlas.com.
English
We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .