IntFold: Een Beheersbaar Fundamentmodel voor Algemene en Gespecialiseerde Biomoleculaire Structuurvoorspelling
IntFold: A Controllable Foundation Model for General and Specialized Biomolecular Structure Prediction
July 2, 2025
Auteurs: The IntFold Team, Leon Qiao, Wayne Bai, He Yan, Gary Liu, Nova Xi, Xiang Zhang
cs.AI
Samenvatting
We introduceren IntFold, een controleerbaar foundation model voor zowel algemene als gespecialiseerde biomoleculaire structuurvoorspelling. IntFold toont voorspellende nauwkeurigheid die vergelijkbaar is met de state-of-the-art AlphaFold3, terwijl het gebruik maakt van een superieur aangepast aandachtskernel. Naast standaard structuurvoorspelling kan IntFold worden aangepast om allosterische toestanden, beperkte structuren en bindingsaffiniteit te voorspellen door het gebruik van individuele adapters. Bovendien introduceren we een nieuw vertrouwenshoofd om de dockingskwaliteit te schatten, wat een meer genuanceerde beoordeling biedt voor uitdagende doelen zoals antigeen-antilichaamcomplexen. Tot slot delen we inzichten die zijn opgedaan tijdens het trainingsproces van dit rekenintensieve model.
English
We introduce IntFold, a controllable foundation model for both general and
specialized biomolecular structure prediction. IntFold demonstrates predictive
accuracy comparable to the state-of-the-art AlphaFold3, while utilizing a
superior customized attention kernel. Beyond standard structure prediction,
IntFold can be adapted to predict allosteric states, constrained structures,
and binding affinity through the use of individual adapters. Furthermore, we
introduce a novel confidence head to estimate docking quality, offering a more
nuanced assessment for challenging targets such as antibody-antigen complexes.
Finally, we share insights gained during the training process of this
computationally intensive model.