HistoAtlas: Ein Pan-Krebs-Morphologie-Atlas, der Histomik mit molekularen Programmen und klinischen Ergebnissen verbindet

HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes

March 17, 2026

Autoren: Pierre-Antoine Bannier

cs.AI

Zusammenfassung

Wir stellen HistoAtlas vor, einen pan-karzinogenen Computermodell-Atlas, der 38 interpretierbare histomische Merkmale aus 6.745 diagnostischen H&E-Präparaten über 21 TCGA-Krebsarten hinweg extrahiert und jedes Merkmal systematisch mit Überleben, Genexpression, somatischen Mutationen und Immunsubtypen verknüpft. Alle Assoziationen sind kovariatenbereinigt, multiplen-Test-korrigiert und in Evidenzstärke-Kategorien eingeteilt. Der Atlas erschließt bekannte biologische Zusammenhänge – von Immuninfiltration und Prognose über Proliferation bis hin zur Kinase-Signalgebung – und deckt dabei kompartimentspezifische Immunsignale sowie morphologische Subtypen mit divergierenden Krankheitsverläufen auf. Jedes Ergebnis ist räumlich auf Gewebekompartimente und einzelne Zellen zurückführbar, statistisch kalibriert und frei abfragbar. HistoAtlas ermöglicht die systematische, großangelegte Biomarker-Entdeckung aus routinemäßigen H&E-Präparaten ohne spezielle Färbungen oder Sequenzierungen. Daten und ein interaktiver Webatlas sind frei verfügbar unter https://histoatlas.com.

English

We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .