HistoAtlas: 조직형태학을 분자 프로그램 및 임상 결과와 연결하는 범암 형태학 아틀라스

초록

저자들은 21가지 TCGA 암종에 속하는 6,745개의 진단용 H&E 슬라이드에서 38개의 해석 가능한 조직형태학적 특징을 추출하고, 각 특징을 생존율, 유전자 발현, 체세포 돌연변이, 면역 아형과 체계적으로 연결하는 범암종(pancancer) 컴퓨테이셔널 아틀라스인 HistoAtlas를 제안합니다. 모든 연관성은 공변량으로 보정되고 다중 검정 보정이 이루어졌으며, 증거 강도 계층으로 분류됩니다. 이 아틀라스는 면역 침윤과 예후부터 증식 및 키나제 신호전달에 이르기까지 알려진 생물학적 지식을 재확인하는 동시에, 구획 특이적 면역 신호와 서로 다른 예후를 보이는 형태학적 아형을 새롭게 발견합니다. 모든 결과는 조직 구획 및 개별 세포 수준에서 공간적으로 추적 가능하며, 통계적으로 보정되었고 공개적으로 조회할 수 있습니다. HistoAtlas는 특수 염색이나 시퀀싱 없이 일상적인 H&E 검사 표본으로부터 체계적이고 대규모의 바이오마커 발견을 가능하게 합니다. 데이터와 상호작용 가능한 웹 아틀라스는 https://histoatlas.com 에서 무료로 이용할 수 있습니다.

English

We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .

HistoAtlas: 조직형태학을 분자 프로그램 및 임상 결과와 연결하는 범암 형태학 아틀라스

HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes

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