HistoAtlas: Пан-раковый морфологический атлас, связывающий гистомику с молекулярными программами и клиническими исходами
HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes
March 17, 2026
Авторы: Pierre-Antoine Bannier
cs.AI
Аннотация
Мы представляем HistoAtlas — пан-раковый вычислительный атлас, который извлекает 38 интерпретируемых гистологических признаков из 6745 диагностических срезов, окрашенных гематоксилином и эозином (H&E), по 21 типу рака из базы данных TCGA и систематически связывает каждый признак с выживаемостью, экспрессией генов, соматическими мутациями и иммунными подтипами. Все ассоциации скорректированы на ковариаты, поправлены на множественное тестирование и классифицированы по уровням достоверности доказательств. Атлас воспроизводит известные биологические процессы, от иммунной инфильтрации и прогноза до пролиферации и киназной сигнализации, одновременно выявляя компартмент-специфические иммунные сигналы и морфологические подтипы с различными исходами. Каждый результат может быть пространственно отслежен до тканевых компартментов и отдельных клеток, статистически калиброван и открыт для запросов. HistoAtlas позволяет проводить систематическое обнаружение биомаркеров в крупных масштабах на основе рутинных срезов H&E без необходимости специального окрашивания или секвенирования. Данные и интерактивный веб-атлас свободно доступны по адресу https://histoatlas.com.
English
We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .