HistoAtlas: 組織形態学を分子プログラムと臨床転帰に関連付けるパンキャンサーモルフォロジーアトラス

HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes

March 17, 2026

著者: Pierre-Antoine Bannier

cs.AI

要旨

HistoAtlasを紹介する。本パン癌計算アトラスは、21種類のTCGA癌種にわたる6,745枚の診断用H&E染色標本から38の解釈可能な組織学的特徴を抽出し、各特徴と生存率、遺伝子発現、体細胞変異、免疫サブタイプとの関連を体系的に解析した。全ての関連は共変量で調整され、多重検定補正が施され、エビデンス強度に基づく階層に分類されている。本アトラスは、免疫浸潤や予後から増殖やキナーゼシグナリングに至る既知の生物学的知見を再現する一方で、組織コンパートメント特異的な免疫シグナルや、異なる転帰を示す形態学的サブタイプを新たに発見した。全ての結果は組織コンパートメントおよび個々の細胞まで空間的に追跡可能で、統計的に較正され、公開された問い合わせシステムを備える。HistoAtlasは、特殊染色やシーケンシングを必要とせず、日常的に用いられるH&E染色標本から、体系的かつ大規模なバイオマーカー発見を可能にする。データおよび対話型ウェブアトラスはhttps://histoatlas.com で無料公開されている。

English

We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .