HistoAtlas: Un Atlas Pan-Cancer de Morfología que Vincula la Histómica con Programas Moleculares y Resultados Clínicos
HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes
March 17, 2026
Autores: Pierre-Antoine Bannier
cs.AI
Resumen
Presentamos HistoAtlas, un atlas computacional pan-cáncer que extrae 38 características histómicas interpretables de 6.745 muestras histológicas de H&E diagnósticas en 21 tipos de cáncer del TCGA, y vincula sistemáticamente cada característica con la supervivencia, la expresión génica, las mutaciones somáticas y los subtipos inmunes. Todas las asociaciones están ajustadas por covariables, corregidas por pruebas múltiples y clasificadas en niveles de solidez de la evidencia. El atlas recupera biología conocida, desde la infiltración inmune y el pronóstico hasta la proliferación y la señalización de quinasas, al mismo tiempo que descubre señales inmunes específicas de compartimento y subtipos morfológicos con resultados divergentes. Cada resultado es espacialmente trazable hasta los compartimentos tisulares y células individuales, estadísticamente calibrado y consultable abiertamente. HistoAtlas permite el descubrimiento sistemático de biomarcadores a gran escala a partir de H&E de rutina, sin necesidad de tinciones especializadas o secuenciación. Los datos y un atlas web interactivo están disponibles gratuitamente en https://histoatlas.com.
English
We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .