HistoAtlas : Un atlas pancancéreux de la morphologie reliant l'histomique aux programmes moléculaires et aux devenirs cliniques
HistoAtlas: A Pan-Cancer Morphology Atlas Linking Histomics to Molecular Programs and Clinical Outcomes
March 17, 2026
Auteurs: Pierre-Antoine Bannier
cs.AI
Résumé
Nous présentons HistoAtlas, un atlas computationnel pan-cancer qui extrait 38 caractéristiques histologiques interprétables à partir de 6 745 lames diagnostiques H&E couvrant 21 types de cancer du TCGA, et qui relie systématiquement chaque caractéristique à la survie, l'expression génique, les mutations somatiques et les sous-types immunitaires. Toutes les associations sont ajustées pour les covariables, corrigées pour les tests multiples et classées en niveaux de force de preuve. L'atlas retrouve des mécanismes biologiques connus, allant de l'infiltration immunitaire et du pronostic à la prolifération et à la signalisation des kinases, tout en révélant des signaux immunitaires spécifiques aux compartiments et des sous-types morphologiques aux pronostics divergents. Chaque résultat est spatialement traçable jusqu'aux compartiments tissulaires et aux cellules individuelles, statistiquement calibré et librement consultable. HistoAtlas permet une découverte systématique et à grande échelle de biomarqueurs à partir de lames H&E de routine, sans coloration spécialisée ni séquençage. Les données et un atlas web interactif sont librement disponibles à l'adresse https://histoatlas.com.
English
We present HistoAtlas, a pan-cancer computational atlas that extracts 38 interpretable histomic features from 6,745 diagnostic H&E slides across 21 TCGA cancer types and systematically links every feature to survival, gene expression, somatic mutations, and immune subtypes. All associations are covariate-adjusted, multiple-testing corrected, and classified into evidence-strength tiers. The atlas recovers known biology, from immune infiltration and prognosis to proliferation and kinase signaling, while uncovering compartment-specific immune signals and morphological subtypes with divergent outcomes. Every result is spatially traceable to tissue compartments and individual cells, statistically calibrated, and openly queryable. HistoAtlas enables systematic, large-scale biomarker discovery from routine H&E without specialized staining or sequencing. Data and an interactive web atlas are freely available at https://histoatlas.com .